Каталог / Приборы

Генетический анализатор НАНОФОР 05

Генетический анализатор НАНОФОР 05-1 предназначен для автоматического определения последовательности ДНК и для проведения фрагментного анализа ДНК. НАНОФОР 05-1 — высокопроизводительный 8-капиллярный прибор, способный автоматически работать в круглосуточном режиме.

Краткое описание, используемый метод

НАНОФОР 05-1 является прибором капиллярного электрофореза с пятицветной лазериндуцированной флуоресцентной детекцией. Проба - смесь фрагментов ДНК, отличающихся на одно звено, или фрагменты ДНК, полученные методом ПЦР в реальном времени, с помощью автоматизированного устройства позиционирования, электрокинетически вводится в капилляры, заполненные гелем. В ходе электрофореза фрагменты ДНК разной длины эффективно разделяются с разрешением в один нуклеотид. При прохождении через окно детектора происходит возбуждение флуорофора, связанного с молекулой ДНК. Сигнал флуоресценции детектируется в одном из пяти каналов в каждом из восьми капилляров. В случае сиквенсных смесей каждый из четырех цветов флуоресценции строго соответствует своему нуклеотиду, а последовательность выхода цветных пиков соответствует последовательности анализируемой ДНК.

Области применения:

  • медицина,
  • санитарно-эпидемиологический контроль,
  • сельское хозяйство, криминалистика,
  • биотехнология,
  • фундаментальные исследования в области анализа нуклеиновых кислот.

Особенности, сравнение с аналогами:

Анализатор позволяет:

  • автоматически заполнять капилляр раствором разделяющего полимера,
  • электрокинетически вводить пробу в капилляр из заданной позиции 96-луночного планшета,
  • проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК при контролируемых значениях силы тока, напряжения и температуры,
  • детектировать сигнал флуоресценции в четырех каналах 520, 550, 580, 610 и 650 нм.
  • проанализировать до 96 образцов без помощи оператора по заданной программе.

Программное обеспечение рассчитано на работу в среде Windows XP, Windows 7 и состоит из двух блоков: блок фрагментного анализа и блок анализа нуклеотидной последовательности.

Программное обеспечение позволяет:

  • задавать параметры эксперимента;
  • визуально контролировать основные параметры в ходе электрофореза;
  • проводить анализ полученных данных в ручном и автоматическом режимах;
  • иметь доступ к необработанным данным.

Специально для прибора разработаны следующие реактивы:

  • разделяющий полимер для фрагментного анализа и для секвенирования;
  • наборы для секвенирования со стандартными (М13, T7) праймерами;
  • маркеры молекулярного веса ДНК.

В стадии разработки находится набор реактивов для секвенирования с флуоресцентно-меченными терминаторами.

Прибор не имеет отечественных аналогов. По своим возможностям прибор не уступает лучшим зарубежным аналогам (ABI Prizm 3500 Applied Biosystems, США) при значительно меньшей цене.

 

Технические характеристики

Детектор Флуориметрический детектор на длины волн
520, 550, 580, 610 и 650 нм
Лазер

Твердотельный, λ = 488 нм, мощность Р = 20 мВт

Разрешение Разрешение одноцепочечных фрагментов ДНК с шагом в один нуклеотид в диапазоне длин до 700 нуклеотидов (достоверность результата > 98%).
Время анализа, ч. 1,5
Источник высокого напряжения Напряжение 20 кВ, ток 1–250  мкА,
нестабильность не более 0.03 %

Ввод пробы

Электрокинетический

Магазин проб и вспомогательных растворов 96-ячеечный планшет для проб, 12 пробирок для вспомогательных растворов объемом от 0.5 до 3 мл
Капилляры (8 штук)

Кварцевые, внутренний диаметр 75 мкм,
наружный диаметр 200 мкм, длина до 500 мм

Термостатирование и контроль температуры Термостат с элементами Пелтье; поддержание температуры капилляра в диапазоне 30–65 (±0.2) °С
Режим работы

Автоматическое перезаполнение геля под давлением до 70 атм. Автоматическое разделения пробы по заданной программе с непрерывным контролем процесса и параметров эксперимента.

Потребляемая мощность, Вт 0,3
Габариты, мм 850x750x600
Масса, кг 75